Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OPALINQ96PE5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPALINQ96PE5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms