Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP53Q96M91 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms