Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms