Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC74BQ96LY2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC74BQ96LY2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms