Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms