Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPNS2Q96L46 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CAPNS2Q96L46 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms