Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BORCS6Q96GS4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BORCS6Q96GS4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms