Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCARF2Q96GP6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF2Q96GP6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF2Q96GP6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF2Q96GP6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF2Q96GP6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF2Q96GP6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF2Q96GP6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF2Q96GP6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF2Q96GP6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF2Q96GP6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF2Q96GP6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF2Q96GP6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF2Q96GP6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF2Q96GP6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCARF2Q96GP6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms