Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms