Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DDX11Q96FC9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX11Q96FC9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms