Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms