Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP13Q92995 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP13Q92995 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP13Q92995 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP13Q92995 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP13Q92995 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP13Q92995 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP13Q92995 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP13Q92995 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP13Q92995 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP13Q92995 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP13Q92995 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP13Q92995 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP13Q92995 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP13Q92995 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP13Q92995 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP13Q92995 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP13Q92995 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP13Q92995 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP13Q92995 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP13Q92995 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP13Q92995 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP13Q92995 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP13Q92995 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP13Q92995 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP13Q92995 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP13Q92995 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP13Q92995 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP13Q92995 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP13Q92995 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP13Q92995 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP13Q92995 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP13Q92995 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP13Q92995 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP13Q92995 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP13Q92995 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP13Q92995 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP13Q92995 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP13Q92995 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP13Q92995 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP13Q92995 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP13Q92995 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP13Q92995 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP13Q92995 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP13Q92995 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP13Q92995 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP13Q92995 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP13Q92995 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP13Q92995 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP13Q92995 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP13Q92995 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP13Q92995 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP13Q92995 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP13Q92995 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP13Q92995 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP13Q92995 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP13Q92995 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP13Q92995 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP13Q92995 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP13Q92995 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP13Q92995 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP13Q92995 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP13Q92995 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP13Q92995 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP13Q92995 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP13Q92995 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP13Q92995 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP13Q92995 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP13Q92995 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP13Q92995 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP13Q92995 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP13Q92995 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP13Q92995 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP13Q92995 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP13Q92995 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP13Q92995 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP13Q92995 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP13Q92995 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP13Q92995 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP13Q92995 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP13Q92995 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP13Q92995 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP13Q92995 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP13Q92995 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP13Q92995 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP13Q92995 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP13Q92995 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP13Q92995 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP13Q92995 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP13Q92995 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP13Q92995 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP13Q92995 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP13Q92995 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP13Q92995 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP13Q92995 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP13Q92995 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP13Q92995 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP13Q92995 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP13Q92995 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP13Q92995 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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