Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRG4Q92954 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
PRG4Q92954 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PRG4Q92954 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PRG4Q92954 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PRG4Q92954 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms