Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KIFAP3Q92845 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms