Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TSKUQ8WUA8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms