Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF30

WHAMM, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMQ8TF30 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WHAMMQ8TF30 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
WHAMMQ8TF30 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
WHAMMQ8TF30 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
WHAMMQ8TF30 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
WHAMMQ8TF30 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
WHAMMQ8TF30 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WHAMMQ8TF30 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WHAMMQ8TF30 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WHAMMQ8TF30 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WHAMMQ8TF30 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WHAMMQ8TF30 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WHAMMQ8TF30 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WHAMMQ8TF30 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WHAMMQ8TF30 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WHAMMQ8TF30 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WHAMMQ8TF30 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WHAMMQ8TF30 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WHAMMQ8TF30 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
WHAMMQ8TF30 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WHAMMQ8TF30 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
WHAMMQ8TF30 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms