Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEDD1Q8NHV4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD1Q8NHV4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms