Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM58Q8NG06 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM58Q8NG06 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM58Q8NG06 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM58Q8NG06 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM58Q8NG06 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM58Q8NG06 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM58Q8NG06 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM58Q8NG06 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRIM58Q8NG06 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRIM58Q8NG06 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM58Q8NG06 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms