Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms