Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM8

AGBL3, Cytosolic carboxypeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL3Q8NEM8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGBL3Q8NEM8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGBL3Q8NEM8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGBL3Q8NEM8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGBL3Q8NEM8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGBL3Q8NEM8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGBL3Q8NEM8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGBL3Q8NEM8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGBL3Q8NEM8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGBL3Q8NEM8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGBL3Q8NEM8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGBL3Q8NEM8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGBL3Q8NEM8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGBL3Q8NEM8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGBL3Q8NEM8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGBL3Q8NEM8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGBL3Q8NEM8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AGBL3Q8NEM8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGBL3Q8NEM8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms