Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTC21AQ8NDW8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC21AQ8NDW8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC21AQ8NDW8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC21AQ8NDW8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC21AQ8NDW8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC21AQ8NDW8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC21AQ8NDW8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC21AQ8NDW8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC21AQ8NDW8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC21AQ8NDW8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC21AQ8NDW8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC21AQ8NDW8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC21AQ8NDW8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC21AQ8NDW8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TTC21AQ8NDW8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TTC21AQ8NDW8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
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TTC21AQ8NDW8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
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TTC21AQ8NDW8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
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TTC21AQ8NDW8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
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TTC21AQ8NDW8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
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TTC21AQ8NDW8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
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TTC21AQ8NDW8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
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TTC21AQ8NDW8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
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TTC21AQ8NDW8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
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TTC21AQ8NDW8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TTC21AQ8NDW8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTC21AQ8NDW8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
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