Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF169Q8NCN4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
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RNF169Q8NCN4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF169Q8NCN4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF169Q8NCN4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF169Q8NCN4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF169Q8NCN4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF169Q8NCN4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF169Q8NCN4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF169Q8NCN4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF169Q8NCN4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF169Q8NCN4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF169Q8NCN4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF169Q8NCN4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF169Q8NCN4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF169Q8NCN4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF169Q8NCN4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF169Q8NCN4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF169Q8NCN4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF169Q8NCN4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF169Q8NCN4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF169Q8NCN4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF169Q8NCN4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF169Q8NCN4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF169Q8NCN4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF169Q8NCN4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF169Q8NCN4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF169Q8NCN4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF169Q8NCN4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF169Q8NCN4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF169Q8NCN4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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