Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NHLRC2Q8NBF2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms