Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNBD1Q8NA66 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNBD1Q8NA66 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms