Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYT2Q8N9I0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT2Q8N9I0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT2Q8N9I0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT2Q8N9I0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT2Q8N9I0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT2Q8N9I0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT2Q8N9I0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT2Q8N9I0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT2Q8N9I0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT2Q8N9I0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT2Q8N9I0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT2Q8N9I0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT2Q8N9I0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT2Q8N9I0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT2Q8N9I0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT2Q8N9I0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT2Q8N9I0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT2Q8N9I0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT2Q8N9I0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms