Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC33Q8N5R6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms