Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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PHTF2Q8N3S3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHTF2Q8N3S3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHTF2Q8N3S3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHTF2Q8N3S3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHTF2Q8N3S3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHTF2Q8N3S3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHTF2Q8N3S3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHTF2Q8N3S3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHTF2Q8N3S3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PHTF2Q8N3S3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHTF2Q8N3S3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHTF2Q8N3S3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHTF2Q8N3S3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PHTF2Q8N3S3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHTF2Q8N3S3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHTF2Q8N3S3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHTF2Q8N3S3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHTF2Q8N3S3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHTF2Q8N3S3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHTF2Q8N3S3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHTF2Q8N3S3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHTF2Q8N3S3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHTF2Q8N3S3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHTF2Q8N3S3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHTF2Q8N3S3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHTF2Q8N3S3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHTF2Q8N3S3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHTF2Q8N3S3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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PHTF2Q8N3S3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHTF2Q8N3S3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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PHTF2Q8N3S3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHTF2Q8N3S3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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PHTF2Q8N3S3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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PHTF2Q8N3S3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHTF2Q8N3S3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHTF2Q8N3S3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHTF2Q8N3S3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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PHTF2Q8N3S3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHTF2Q8N3S3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHTF2Q8N3S3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF2Q8N3S3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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PHTF2Q8N3S3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF2Q8N3S3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF2Q8N3S3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF2Q8N3S3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF2Q8N3S3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF2Q8N3S3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF2Q8N3S3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF2Q8N3S3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF2Q8N3S3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF2Q8N3S3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF2Q8N3S3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF2Q8N3S3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF2Q8N3S3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF2Q8N3S3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHTF2Q8N3S3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHTF2Q8N3S3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHTF2Q8N3S3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHTF2Q8N3S3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHTF2Q8N3S3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
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