Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C17orf53Q8N3J3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms