Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms