Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms