Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVF7

FMNL3, Formin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMNL3Q8IVF7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FMNL3Q8IVF7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms