Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTU1Q7Z7A3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms