Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMC4Q7Z404 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMC4Q7Z404 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms