Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT27Q7Z3Y8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT27Q7Z3Y8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms