Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLRP9Q7RTR0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NLRP9Q7RTR0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NLRP9Q7RTR0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRP9Q7RTR0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRP9Q7RTR0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRP9Q7RTR0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRP9Q7RTR0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRP9Q7RTR0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRP9Q7RTR0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRP9Q7RTR0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRP9Q7RTR0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRP9Q7RTR0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRP9Q7RTR0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRP9Q7RTR0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRP9Q7RTR0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRP9Q7RTR0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRP9Q7RTR0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRP9Q7RTR0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRP9Q7RTR0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRP9Q7RTR0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRP9Q7RTR0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLRP9Q7RTR0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLRP9Q7RTR0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLRP9Q7RTR0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLRP9Q7RTR0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLRP9Q7RTR0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms