Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
XIRP1Q702N8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms