Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms