Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT07

TBC1D9, TBC1 domain family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D9Q6ZT07 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TBC1D9Q6ZT07 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBC1D9Q6ZT07 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBC1D9Q6ZT07 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBC1D9Q6ZT07 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBC1D9Q6ZT07 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBC1D9Q6ZT07 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBC1D9Q6ZT07 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TBC1D9Q6ZT07 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBC1D9Q6ZT07 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBC1D9Q6ZT07 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBC1D9Q6ZT07 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBC1D9Q6ZT07 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBC1D9Q6ZT07 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBC1D9Q6ZT07 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBC1D9Q6ZT07 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBC1D9Q6ZT07 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBC1D9Q6ZT07 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBC1D9Q6ZT07 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBC1D9Q6ZT07 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBC1D9Q6ZT07 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBC1D9Q6ZT07 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBC1D9Q6ZT07 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBC1D9Q6ZT07 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBC1D9Q6ZT07 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBC1D9Q6ZT07 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TBC1D9Q6ZT07 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBC1D9Q6ZT07 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBC1D9Q6ZT07 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TBC1D9Q6ZT07 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms