Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFXL1Q6ZNB6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFXL1Q6ZNB6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms