Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CXCL17Q6UXB2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL17Q6UXB2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms