Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMBR1LQ6UX01 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMBR1LQ6UX01 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LMBR1LQ6UX01 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMBR1LQ6UX01 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMBR1LQ6UX01 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LMBR1LQ6UX01 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LMBR1LQ6UX01 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LMBR1LQ6UX01 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMBR1LQ6UX01 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMBR1LQ6UX01 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms