Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWI4

SHISA2, Protein shisa-2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA2Q6UWI4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms