Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATRAIDQ6UW56 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms