Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT2Q6UVM3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT2Q6UVM3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT2Q6UVM3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT2Q6UVM3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT2Q6UVM3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT2Q6UVM3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT2Q6UVM3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT2Q6UVM3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT2Q6UVM3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT2Q6UVM3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT2Q6UVM3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT2Q6UVM3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT2Q6UVM3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT2Q6UVM3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT2Q6UVM3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT2Q6UVM3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT2Q6UVM3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT2Q6UVM3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT2Q6UVM3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT2Q6UVM3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT2Q6UVM3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT2Q6UVM3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT2Q6UVM3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms