Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZBED9Q6R2W3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms