Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC1

JMJD6, Bifunctional arginine demethylase and lysyl-hydroxylase JMJD6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD6Q6NYC1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
JMJD6Q6NYC1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
JMJD6Q6NYC1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms