Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRRC8EQ6NSJ5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC8EQ6NSJ5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms