Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCTP1Q6DN14 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCTP1Q6DN14 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms