Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB3L3Q68CJ9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms