Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E4F1Q66K89 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms